Институт профессиональных инноваций был создан в 1996 году в качестве некоммерческой организации, оказывающей образовательные услуги в сфере высшего образования по гуманитарным специальностям. На первом этапе своего развития, приоритетным направлением деятельности Института стало создание и развитие региональной сети филиалов, имеющее целью повышение доступности и качества образования в различных субъектах РФ. Под руководством первого ректора Института – доктора юридических наук, профессора Борисовой Н.Л. были организованы филиалы в городах Мирный, Нерюнгри, Тула, Вологда и др. К преподавательской деятельности привлекались ведущие специалисты, доценты и профессора столичных вузов, что, послужило серьезным поводом к укреплению репутации ИПИ в роли надежного учебного заведения, в котором доступность образования сочетается с поддержанием высокой планки качества преподавания дисциплин и обеспеченности учебными ресурсами. В период с 1996 по 2000 годы под авторством преподавателей Института вышли в свет десятки учебников, монографий, пособий и статей.
В настоящее время, под руководством Ректора Хуриева А.А. институт развивается по следующим направлениям: